Metagenomika je definirana kao izravna genetska analiza genoma sadržanih u uzorku okoliša Polje je u početku započelo kloniranjem DNK okoliša, nakon čega slijedi probir funkcionalne ekspresije [1], a zatim je brzo dopunjen izravnim slučajnim sekvenciranjem DNK okoliša [2, 3].
Kakav je proces metagenomike?
Metagenomika uključuje dobivanje DNK od svih mikroorganizama unutar zajednice, bez nužnog identificiranja svih uključenih vrsta. Nakon što se geni sekvenciraju i uspoređuju s identificiranim sekvencama, funkcije ovih gena mogu se odrediti.
Koja se tehnika koristi u metagenomici?
Uzorak mikrobne zajednice prikuplja se iz morske vode, sedimenta, životinje domaćina ili drugog morskog staništa. Sakupljene stanice se zatim liziraju i DNA se ekstrahira iz njihovog lizata. Tehnika koja omogućuje metagenomiku je sekvenciranje sačmaricama, koja sekvencira nasumične regije DNK na neciljani način.
Koja su 3 koraka za proučavanje metagenomije?
Koraci i proces metagenomike:
- Uzorak zbirke:
- vađenje DNK:
- Priprema uzorka:
- Uzorak analize:
Kako se izvodi funkcionalna metagenomika?
Funkcionalna metagenomika uključuje izolaciju DNK iz mikrobnih zajednica radi proučavanja funkcija kodiranih proteina. Uključuje kloniranje fragmenata DNK, ekspresiju gena u zamjenskom domaćinu i probir za enzimske aktivnosti.